MYC参与转录调控的研究进展
MYC蛋白家族成员包括C-MYC、N-MYC及L-MYC。MYC对其核心靶基因的调控主要依赖于其与启动子区域E-box的高亲和力结合；而对于那些条件特异性的MYC靶基因，则更多地依赖于增强子的调控作用。在这些增强子区域，MYC的结合亲和力相对较低，且更加依赖于蛋白-蛋白相互作用、非特异性DNA相互作用或是替代的DNA motif来实现其调控功能。MYC增强子活性的独特调控机制，以及其在肿瘤中过度表达时增强子侵入现象更为显著的事实，提供了一个极具潜力的治疗靶点。
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eccDNA鉴定分析中的生物信息学进展
染色体外环状DNA（eccDNA）是一类独特的源自染色体的环状DNA分子，与癌基因扩增紧密相关。随着高通量测序技术的发展，基于测序数据的生物信息学方法已成为eccDNA鉴定和功能分析的主要手段。目前，eccDNA相关数据库整合了先前已鉴定的eccDNA，并提供了全面的功能注释和预测，从而成为eccDNA研究中的宝贵资源。本综述收集了约20种可用的eccDNA相关生物信息学工具，包括鉴定工具和注释数据库，并总结了它们的特性和功能。通过在模拟数据上评估一些eccDNA检测方法，为未来eccDNA的检测提供了建议。此外，作者还讨论了生物信息学方法在当前eccDNA研究中的局限性和前景。
低剂量干扰素-γ维持急性髓系白血病干细胞自我更新
Low doses of IFN-γ maintain self-renewal of leukemia stem cells in acute myeloid leukemia
干扰素-γ（IFN-γ）是由免疫细胞产生的一种重要细胞因子，主要包括活化的T淋巴细胞、自然杀伤细胞（NK细胞）和NKT细胞。曾经有许多临床试验评估IFN-γ作为抗肿瘤药物，但结果矛盾。在一些试点和小规模的临床研究中，发现IFN-γ在体内对AML具有抗白血病效果。相反，有大量证据表明肿瘤细胞可以利用IFN-γ信号诱导抗炎反应和促肿瘤效应。最近的一些研究描述了IFN-γ与肿瘤干细胞（CSCs）之间的密切关系，暗示IFN-γ可能参与肿瘤的进展。然而，IFN-γ在LSCs中的作用以及IFN-γ如何影响白血病发生的机制仍然未知。
肿瘤转移与氨基酸代谢
Metabolic control of cancer metastasis: role of amino acids at secondary organ sites
肿瘤细胞从原发部位扩散到远处器官是导致肿瘤相关死亡的主要因素，目前在大部分情况下难以治愈。尽管肿瘤转移在临床上普遍存在，但转移级联本身的效率非常低——只有0.02%的循环肿瘤细胞（CTCs）最终会形成临床可检测到的转移灶。1889年，英国外科医生Stephen Paget观察到肿瘤转移到的次生部位似乎并不完全是随机的。他提出了“种子和土壤”转移模型的假设，认为CTCs（种子）只有在“土壤”或转移部位是适合的环境时，才能成功扎根并建立转移性肿瘤。延续Paget的比喻，最近的证据表明这个“土壤”中营养物质的丰富程度可能是肿瘤细胞适应的一个关键方面。
突变标记和体细胞驱动突变
体细胞突变（Somatic mutations）是指在生命过程中获得的自发的遗传变异。突变标记（mutational signature）是指在基因组中反映不同突变过程的特定的突变模式。不同的组织可受到不同的致突变因素的影响，这些因素在基因组中留下了不同的突变特征。每种突变标记意味着突变并不是随机出现在基因组中，而是根据其病因在特定的基因组核苷酸环境中表现出来。通过分析基因组中的突变标记，可以揭示组织中存在的突变过程。
蛋白磷酸化、泛素化以及糖基化
GSK3β-driven SOX2 overexpression is a targetable vulnerability in esophageal squamous cell carcinoma
食管鳞状细胞癌（ESCC）是目前缺乏批准的靶向治疗方法的最致命的人类恶性肿瘤之一。越来越多的证据表明，SOX2基因的过度表达是ESCC和其他鳞状细胞癌形成的关键因素之一。在本研究中，作者通过筛选小分子激酶抑制剂库，确定了GSK3β是在ESCC细胞中调节SOX2高表达的一个关键激酶。GSK3β并没有通过转录促进SOX2的表达，但它对于SOX2蛋白的稳定性是必需的。