单细胞测序数据质控原理及过滤方法
在单细胞转录组分析中，需关注多个指标对细胞进行过滤，进而提高数据分析的准确性和可靠性。以下是对线粒体基因、核糖体基因、血红蛋白基因、nFeature（基因数目）和nCount（分子总数）的概述，通常会根据具体的数据集和分析目标来设定这些质控指标的阈值。可以使用可视化工具（如小提琴图）来观察数据的分布情况，并使用相应的代码或工具来过滤掉不符合质控标准的细胞，从而得到更干净、更可靠的单细胞测序数据。
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conda安装HiCExplorer卡在Solving environment的问题
使用HiC-Pro分析完Hi-C数据之后，打算用HiCExplorer对TAD进行分析绘图。
按照HiCExplorer官网建议，通过conda安装。numpy、scipy安装都很顺利，但到hicexplorer时就卡住了。一直卡在Solving environment，安装失败。
Fastp提示sequence and quality have different length错误
使用HiC-pro软件分析测序数据，在bowtie2序列比对过程中出现错误。
于是尝试用Fastp软件处理下fastq文件。结果出现了详细的错误提示：sequence and quality have different length
HiC-Pro在序列比对后出现logsmergeSAM.log错误
使用HiC-Pro软件分析Hi-C数据，在bowtie2比对完_R1、_R2.fastq后进行pair流程时出现错误提示：
Pairing of R1 and R2 tags ...
Logs: logs/GSMxxxxx/mergeSAM.log
make: [/mnt/data/soft/hicpro/HiC-Pro_3.1.0/bin/../scripts//Makefile:144：bowtie_pairing] 错误 1
Forward and reverse reads not paired. Check that BAM files have the same read names and are sorted.