在单细胞转录组分析中，需关注多个指标对细胞进行过滤，进而提高数据分析的准确性和可靠性。以下是对线粒体基因、核糖体基因、血红蛋白基因、nFeature（基因数目）和nCount（分子总数）的概述，通常会根据具体的数据集和分析目标来设定这些质控指标的阈值。可以使用可视化工具（如小提琴图）来观察数据的分布情况，并使用相应的代码或工具来过滤掉不符合质控标准的细胞，从而得到更干净、更可靠的单细胞测序数据。

- 阅读剩余部分 -

细胞周期（Cell Cycle）是指连续分裂的细胞从一次分裂完成时开始，到下一次分裂完成时为止所经历的全过程。它主要包括两个阶段：分裂间期和分裂期。其中，处于分裂间期（Interphase）的细胞数量最多。G1期、S期、G2期中，处于G1期的细胞最多。各周期中，正常细胞和肿瘤细胞在功能、持续时间、细胞状态以及对损伤的反应等方面存在差别。

- 阅读剩余部分 -

邻近标记技术（Proximity Labeling, PL）利用特定的酶将标记物（如生物素）共价连接到目标蛋白附近的蛋白质上，从而实现对邻近蛋白质的标记和后续分析。这种标记可以通过质谱技术进行检测，进而揭示蛋白质之间的相互作用关系。这一技术的出现，不仅为蛋白质相互作用研究提供了新的工具和视角，还极大地推动了对细胞信号传导、代谢调控等重要生物过程的深入理解。

- 阅读剩余部分 -

染色体外环状DNA（eccDNA）是一类独特的源自染色体的环状DNA分子，与癌基因扩增紧密相关。随着高通量测序技术的发展，基于测序数据的生物信息学方法已成为eccDNA鉴定和功能分析的主要手段。目前，eccDNA相关数据库整合了先前已鉴定的eccDNA，并提供了全面的功能注释和预测，从而成为eccDNA研究中的宝贵资源。本综述收集了约20种可用的eccDNA相关生物信息学工具，包括鉴定工具和注释数据库，并总结了它们的特性和功能。通过在模拟数据上评估一些eccDNA检测方法，为未来eccDNA的检测提供了建议。此外，作者还讨论了生物信息学方法在当前eccDNA研究中的局限性和前景。

- 阅读剩余部分 -