使用HiC-Pro软件分析Hi-C数据，在bowtie2比对完_R1、_R2.fastq后进行pair流程时出现错误提示：
Pairing of R1 and R2 tags ...
Logs: logs/GSMxxxxx/mergeSAM.log
make: [/mnt/data/soft/hicpro/HiC-Pro_3.1.0/bin/../scripts//Makefile:144：bowtie_pairing] 错误 1
Forward and reverse reads not paired. Check that BAM files have the same read names and are sorted.

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MNase（Micrococcal nuclease）是一种特殊的核酸酶，广泛应用于染色质结构和核蛋白相互作用的研究中。
甲醛是一种常用的交联剂，用于固定细胞或组织中的染色质和蛋白质分子，以稳定其相互作用并保护其结构。CUT&RUN实验中，甲醛交联可以使染色质和核蛋白复合物的结构变得更加紧密和稳定，这可能会增加MNase酶切割的难度.
使用CST或诺唯赞的CUT&RUN kit中的pG-MNase时，切割不充分会影响靶片段释放，

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